科研路上，少走弯路的工具都在这

NCBI 出品的生物医学文献检索引擎，收录 3700 万+ 条题录，生命科学检索第一站

科睿唯安核心合集，做引文分析、查影响因子与分区的权威库

覆盖面最广的学术搜索，找预印本、学位论文、被引文献很好用

欧洲版 PMC，开放获取全文多，支持全文检索和 API

AI 驱动的学术搜索，自动生成摘要要点（TLDR），语义检索能力强

生命科学预印本平台，看领域最前沿工作，比正式发表快 6-12 个月

输入一篇文献生成引文关系图谱，快速摸清一个陌生领域的脉络

文献推荐与可视化，像「文献界的 Spotify」，可持续追踪某个主题

开源免费的文献管理器，插件生态强，支持 Word/LaTeX，新手首推

老牌商业文献管理软件，期刊投稿样式库最全，多数高校有正版授权

Elsevier 旗下文献管理器，自带 PDF 阅读与社交推荐

中文期刊、学位论文、会议论文最全的数据库

中文科研平台，期刊导航、文献订阅、影响因子查询一站式

按关键词/作者订阅，新文献自动推送到邮箱和微信

美国国立生物技术信息中心，Gene/Nucleotide/Protein/SRA 等数据库总入口

序列相似性比对的行业标准工具，核酸、蛋白、跨物种同源分析必备

EMBL-EBI 的基因组浏览器，基因结构、转录本、变异注释信息完整

加州大学圣克鲁兹基因组浏览器，多轨道可视化与 BLAT 比对

NCBI 出品，设计引物的同时自动做特异性检验，qPCR 引物首选

经典引物设计算法，参数可精细调节，很多工具的底层引擎

质粒图谱绘制与虚拟克隆，Viewer 版永久免费，实验室标配

云端分子生物学工作台，序列设计 + 实验记录 + 团队协作

非营利质粒共享库，7 万+ 质粒，附完整图谱与文献出处

杰克森实验室维护，小鼠基因、品系、表型的权威数据库

系统性敲除小鼠表型数据，查某个基因敲了会有什么表型

CRISPR sgRNA 在线设计，支持多物种，输出脱靶与效率评分

EMBL-EBI 多序列比对工具，看跨物种保守性的常用选择

批量做 ID 转换与基因注释提取（如 Ensembl ID 转 Gene Symbol）

全球最权威的蛋白质序列与功能注释数据库，蛋白研究第一站

蛋白质结构数据库，收录全部公开的实验解析三维结构

DeepMind 与 EMBL-EBI 联合发布，覆盖 2 亿+ 蛋白的结构预测模型

基于同源模板的蛋白结构建模服务器，上手快、结果可解释

蛋白结构可视化的行业标准，发表级出图能力强

新一代分子可视化软件，学术用途免费，冷冻电镜密度图支持好

整合 Pfam、SMART 等多个数据库的蛋白结构域与功能位点预测

在线计算蛋白分子量、等电点、消光系数、不稳定指数

蛋白互作网络数据库，整合实验、共表达与文本挖掘证据

翻译后修饰位点专业数据库，磷酸化、泛素化研究必查

人类蛋白表达图谱，组织/细胞/病理层面的表达与定位数据

PDB 官方网页版 3D 结构查看器，免安装、支持大型复合物

全球最大的高通量基因表达数据仓库，公共数据挖掘的起点

基于 TCGA 与 GTEx 的在线分析平台，肿瘤 vs 正常表达、生存分析零代码

人类正常组织基因表达图谱，54 个组织的表达量与 eQTL 数据

整合 TCGA、GTEx、ICGC 等多套大型队列数据，支持在线可视化

基因列表功能富集一站式分析，结果图可直接用于发表

经典功能注释与富集分析工具，GO/KEGG 分析老牌选择

京都基因与基因组百科全书，通路图的权威来源

基因本体论，功能分类的标准词表（BP/CC/MF 三大类）

蛋白互作网络在线构建，可直接导出到 Cytoscape

网络可视化与分析桌面软件，插件生态丰富（MCODE、cytoHubba）

网页版生信分析平台，无需命令行即可跑 RNA-seq 完整流程

国产在线生信分析平台，中文界面，肿瘤与泛癌分析模块丰富

国产在线绘图与统计平台，200+ 图表类型，支持一键导出 PDF

中文生信绘图平台，热图、火山图、箱线图等常用图开箱即用

R 语言单细胞分析黄金标准包，文档完善、社区活跃

Python 生态的单细胞分析框架，大数据集处理效率高

CZI 出品，在线浏览与下载标准化单细胞数据，可直接网页查基因

人类细胞图谱国际计划，最权威的人体单细胞数据来源

细胞类型 marker 基因数据库，人和小鼠均覆盖，注释必查

单细胞 marker 基因与公共数据集检索数据库

肿瘤免疫单细胞数据库，肿瘤微环境研究的现成资源

基于参考数据集的自动细胞类型注释 R 包

轻量级自动细胞注释工具，免疫细胞注释效果好，有网页版

UCSC 的单细胞数据在线浏览平台，收录数百套公开数据

空间转录组分析 Python 框架，Scanpy 的空间扩展

细胞间通讯分析 R 包，推断配体-受体互作网络

生物医学领域最常用的统计+绘图软件，引导式选择统计方法

工程与理科常用的绘图与数据分析软件，图表类型丰富

社会科学与临床研究常用统计软件，操作界面友好

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R 语言主流集成开发环境，新手入门必备

NIH 出品的科研图像处理软件，荧光定量与 Western 灰度分析标准工具

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用自然语言提问，从 2 亿+ 论文中给出带出处的循证答案

AI 文献综述助手，可批量提取多篇论文的方法、样本量、结论

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内置 AI 摘要（TLDR），免费且无使用门槛

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英文语法与表达检查，写邮件、写 cover letter 很实用

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中文科研人最常用的选刊工具，分区、影响因子、审稿周期、录用率一站查

官方分区数据发布平台，单位考核多以此为准

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Springer Nature 官方选刊工具，含开放获取费用信息

在线 LaTeX 编辑器，内置数千种期刊投稿模板，支持多人协作

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动物实验报告规范 2.0 版，多数期刊要求动物研究必须遵循

全球唯一学者标识符，投稿、基金申请的标准身份 ID，务必注册

学术查重服务，投稿前自查重复率，多数高校提供机构账号

记录审稿与发表履历，评职称和申请基金时有用

科睿唯安官方影响因子与 JCR 分区数据来源

撤稿观察数据库，引用前查一下这篇文献有没有被撤稿

英文语法与表达检查，写 cover letter 和 response letter 实用

开放式实验方案平台，支持版本管理、分支与 DOI 引用

同行评议的实验方案期刊，多数方案来自高水平论文原作者

Nature 系列方法学期刊，步骤最详尽、含排错表

科研实验操作视频库，手法类实验学习效率最高

冷泉港实验室方法数据库，分子与细胞生物学经典方案

质粒操作、病毒包装、转染等分子克隆常规操作，免费且写得清楚

抗体应用（WB/IHC/IF/流式）protocol 与排错指南，实用性强

Cell Signaling 的信号通路图与 WB 优化指南，通路研究常用

分子克隆酶切、连接、PCR 的在线计算与兼容性查询

细胞培养、转染、蛋白与核酸提取的完整技术手册

中文实验方法与经验社区，本土化程度高，故障排查帖子多

跨 Nature Protocols、SpringerProtocols 的方法检索入口

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全球最大的小鼠品系资源库，含品系背景、繁育与表型说明

系统性敲除小鼠的标准化表型数据，开题前必查

美国 NIH 支持的突变小鼠资源中心，可检索与索取品系

动物实验报告规范，含 Essential 10 必报项与 checklist 模板

斑马鱼模式生物信息库，品系、基因、表达与表型

果蝇基因组与遗传学权威数据库

秀丽隐杆线虫基因组与遗传信息库

大鼠基因组数据库，含品系、表型与疾病模型注释

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免费统计功效分析软件，做 power analysis 算样本量的常用工具

杰克森实验室的小鼠表型数据库，可查各品系的基线生理指标

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云端研发平台，实验记录 + 序列设计 + 库存管理一体，学术版有免费额度

免费实验室库存与订购管理平台，试剂耗材台账好用

NIH 化合物数据库，查结构、性质、安全信息与文献

英国皇家化学会化合物数据库，结构检索与物性数据

中文化学品数据库，可查 MSDS 安全说明、理化性质与供应商

全能型笔记与项目管理工具，管课题进度、组会记录、文献清单

本地优先的双链笔记软件，适合搭建个人科研知识库

国内协作文档，多维表格适合做试剂台账与排班表，免翻墙

欧洲核子研究中心支持的开放数据仓库，可为数据集申请 DOI

科研数据与图表共享平台，投稿时上传补充数据常用

开放科学框架，项目预注册与全流程数据管理